Caracterización molecular de 13 especies de Agave L. utilizando como marcador un fragmento del gen rbcL

Abstract

"Las plantas de agave son de gran relevancia en México debido a su estatus cultural, histórico y social, así como por sus diversas aplicaciones en la industria. No obstante, las técnicas de identificación y clasificación taxonómica clásicas no han logrado comprender la compleja diversidad y filogenia del género, por lo que, la aplicación de técnicas molecular como los “Códigos de Barras de ADN” son cada vez más indispensables. En este trabajo de investigación se utilizó esta técnica molecular aplicando una región del gen rbcL como marcador para analizar su capacidad de identificación y discriminación en 13 especies del género Agave L. Para ello se llevó a cabo la colecta de tejido vegetal y se realizó la extracción de ADN seguido de la amplificación por PCR de todas las muestras vegetales colectadas. Después, se analizaron las secuencias obtenidas (secuencias de consulta) con apoyo de los programas bioinformáticos SnapGene Viewer y MEGA X y se crearon dos bibliotecas en formato FASTA. Posteriormente se evaluó el poder discriminatorio de rbcL mediante el análisis BLAST para cada secuencia de consulta generada. Finalmente, con el método estadístico de unión de vecinos (neighbor-joining) se generó un dendrograma para 12 secuencias de consulta en el que se observó la formación de tres clados monofiléticos bien definidos, sin embargo, los clados no lograron agruparse de acuerdo con la clasificación de subgéneros propuesta en literatura. En conclusión, es necesario continuar con investigación relacionada con la capacidad discriminatoria del marcador rbcL en especies de Agave L. "