Caracterización molecular de quercus spp. utilizando los fragmentos rbcl e its2 como marcadores

Abstract

"Las especies de la familia Quercus son de gran importancia ecológica y económica. Sin embargo, su identificación basada en métodos taxonómicos tradicionales se ha visto limitada, por lo que, en esta investigación se utilizó la herramienta molecular “Código de Barras de ADN” utilizando los fragmentos rbcL e ITS2 como marcadores moleculares para la caracterización de especies de encinos. Para ello, se utilizaron 15 muestras de cinco especies del género Quercus para cada marcador. Se realizó la extracción de ADN y la amplificación mediante PCR de las muestras colectadas. Las secuencias “consulta” obtenidas fueron analizadas mediante los programas UGENE y MEGAX, generando así las secuencias consenso de cada especie. Mediante la herramienta bioinformática BLAST, se logró la identificación a nivel género de todas las secuencias (con ambos marcadores), mientras que con el método de vecinos cercanos se realizó un dendrograma en el cual las 15 secuencias obtenidas para ITS2 se agruparon en tres clados bien definidos, mientras que con el marcador rbcL el resultado obtenido de las 14 secuencias analizadas mostró inconformidades. Por último, se observaron superposiciones en el análisis de la Brecha de código de barras en las secuencias analizadas con ambos marcadores. Se deduce finalmente la eficacia del marcador ITS2 en la identificación de especies del género Quercus"