Variabilidad genetica y patogenica de phytophthora cinnamomi rands en Michoácan México

Abstract

"El trabajo de investigación se realizó en la Universidad Autónoma Agraria Antonio Narro en Saltillo, en el Centro de Investigación y de Estudios Avanzados (CINVESTAV-IPN) Unidad Irapuato y el Centro de Ciencias Químico Biológicas de la Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo en el periodo de Marzo del año 2003 a Julio del año 2005. Teniendo como objetivo determinar los grupos de compatibilidad sexual, variabilidad genética, y patogénica de aislados de Phytophthora cinnamomi Rands obtenidos de la región productora de aguacate de Michoacán, México. Se determinó la presencia de los grupos de compatibilidad sexual A1 y A2 de P. cinnamomi, en 25 aislados obtenidos de cinco localidades del estado de Michoacán, México. Los aislados se confrontaron en medio jugo V8-agar clarificado, se determinó la producción de oosporas. Se identificó el grupo de compatibilidad sexual A1 mediante PCR, usando el iniciador OPS-13, el cuál amplifica una banda de 2.7 kb. Se identificaron seis aislados como grupo de compatibilidad sexual A1 y 19 aislados A2; sin embrago de los aislados A1, solo uno produjo oosporas al confrontarse con el restos de los aislamientos. Una vez determinados los grupos de compatibilidad sexual, se realizó un segundo muestreo obteniendo 42 aislados, a las cuales se les determinó variabilidad genética utilizando polimorfismos de ADN amplificados al azar (RAPDs) y polimorfismos de la longitud de los fragmentos amplificados (AFLP). En RAPDs, se utilizaron 21 oligonucleótidos de 10 bases, los cuales mostraron un total de 23 bandas. Para AFLP, las amplificaciones mostraron 296 bandas; el análisis en ambos casos consistió en la obtención de la matriz de disimilaridades genéticas utilizando el coeficiente de apareamiento múltiple y el método del promedio no ponderado, para la obtención del dendograma. Los aislados se clasificaron dentro de dos grupos principales; asociados con la localización geográfica de la cual fueron obtenidos los aislados. El análisis y la determinación de los niveles de confianza muestran que estas agrupaciones geográficas son extremadamente fuertes. Se seleccionaron ocho variantes genéticas de P. cinnamomi, obteniendo el inóculo a partir de cepas en crecimiento activo en medio de cultivo V-8 agar clarificado. inoculando nueve plantas de aguacate, con cada una de las variantes genéticas y las plantas testigo fueron tratadas con agua destilada estéril. Se determinó la incidencia y severidad de la enfermedad, esta última en base a la escala propuesta por Zentmyer (1984). Los datos fueron analizados por medio del análisis multivariado utilizando el programa SAS (Statistical Analysis System). Las pruebas de medias fueron realizadas por Tukey al 0.05. La incidencia de P. cinnamomi en las plantas de aguacate, presentó diferencia significativa en la cepa C4 con respecto al Testigo. Referente a severidad, de acuerdo al análisis se obtuvo que las cepas C6 , C7 y C8 provenientes de Uruapan y Peribán murieron al final del experimento; mientras que las cepas C3, C4 y C5 presentaron solamente daños severos y las cepas C1 y C2 de Salvador Escalante ambas presentaron un daño moderad; por lo que este estudio demostró la variabilidad genética y patogénica que presentan cepas de Phytophthora cinnamomi obtenidas en poblaciones a 60 kilómetros de distancia."