Sesgo en la estimación de efectos de QTLs en experimentos de retrocruzas.

Abstract

"Un problema asociado con la metodología en las investigaciones de QTLs es el sesgo en la estimación del número y efecto de estos. Esto se hizo evidente cuando fue reportado por Beavis (1994). El objetivo del presente estudio fue evaluar el sesgo en la estimación de los efectos de QTLs bajo diferentes condiciones experimentales en mapeo de regresión por intervalos en retrocruzas. Para realizar lo anterior se trabajó con tres factores experimentales: tamaño de muestra (100, 200 y 300), heredabilidad (10 y 5 por ciento) y número de marcadores (2, 4 y 6) . Se estableció un grupo de ligamiento de 100 cM donde se distribuyeron uniformemente cada una de las diferentes densidades v de marcadores y con la combinación entre este factor con heredabilidad y tamaño de muestra se obtuvieron 18 diferentes condiciones experimentales. Con la utilización de simulaciones se generaron los datos para la presente investigación. El análisis de los datos se llevo al cabo a través del programa SATORI (Reyes, 2003). El análisis de los resultados indica que existe una tendencia a sobreestimar el valor absoluto de los efectos de los QTLs y que la magnitud del sesgo está estrechamente relacionada con las condiciones experimentales y la heredabilidad del QTL en cuestión. Desde el punto de vista puramente estadístico, el sesgo obedece a una correlación positiva entre el valor estimado del efecto y el valor del estadístico de prueba; esto acoplado a la regla de decisión que selecciona valores altos de dicho estadístico, a fin de declarar la presencia de un QTL."