Evaluación de nuevos iniciadores para código de barras de la vida con el Gen matK en seis asparagaceas de zonas áridas

Abstract

"Las zonas áridas y semiáridas de México comprenden unas de las regiones con mayor riqueza de especies vegetales en el mundo. Muchas de estas especies no han sido clasificadas taxonómicamente y esta no es una tarea sencilla. La clasificación molecular con los iniciadores universales del gen de la maturasa K (matK) como código de barras de la vida son efectivos en un gran número de plantas, pero pueden no funcionar para todos los géneros. Recientemente, para el género Dasylirion, se diseñó un nuevo par de iniciadores matK efectivos para todas las especies evaluadas de este género. La eficacia de estos nuevos iniciadores en otras especies de la familia Asparagaceae, ayudará a caracterizarlas y dará información importante para los programas de conservación de la biodiversidad de flora de zonas áridas y semiáridas de México. El objetivo de este trabajo fue evaluar si estos nuevos iniciadores matK diseñados para el género Dasylirion, son útiles en la amplificación del gen matK de otras especies de la familia Asparagaceae de zonas áridas. Se colectaron hojas de Nolina cespitifera, Agave lechuguilla, Yucca carnerosana, Manfreda maculosa, Agave salmiana y Hesperaloe palviflora. Se aisló DNA, se evaluó su integridad en gel de agarosa al 1%, y se determinó concentración y pureza en NanoDrop ND-1000. Se amplificó el gen matK mediante PCR (kit BioLabs) con los nuevos iniciadores matK 335F (TTTCATTCTCGTTGCGATTAG) y matK 1327R (ACTTTATTCGATACAAACCCTGTT). Los productos de PCR fueron sometidos a electroforesis en gel de agarosa al 1%. Los resultados muestran bandas amplificadas en cada una de las especies evaluadas. El nuevo par de iniciadores especialmente diseñados para Dasylirion, pueden ser utilizados en código de barras de la vida en otras especies de la familia Asparagaceae"