Anotación y análisis transcriptómico de la familia de genes de la Malato Deshidrogenasa en Phaseolus vulgaris en el proceso simbiótico

Abstract

"La malato deshidrogenasa (MDH) es una enzima conservada evolutivamente y presenta diferentes isoformas. Es una enzima importante que tiene un papel en diferentes procesos bioquímicos de la célula, principalmente en la producción de energía durante el ciclo de Krebs y la ubicación subcelular de las isoenzimas puede variar, en eucariotas se sabe que se localiza en la mitocondria, en el citoplasma y en plantas se ha encontrado en el cloroplasto, el glioxisoma y el peroxisoma. Las malato deshidrogenasas catalizan la interconversión de malato a oxalacetato utilizando NAD como cofactor a excepción de la isoforma plastidial, la cual se sabe que utiliza NADP como cofactor. Las leguminosas son relevantes en varios aspectos ya que pueden ser una fuente importante de proteínas y minerales y pueden establecer relaciones simbióticas con bacterias y hongos presentes en el suelo. El cultivo de frijol en México tiene una relevancia cultural y económica, la anotación y función de las MDH en del frijol en el proceso simbiótico permitirá entender su posible función en el proceso de simbiótico. Se identificaron ocho secuencias con los dominios Ldh_1_N y Ldh_1_C, la distribución de los genes fue en cinco cromosomas. El análisis realizado en los transcriptomas relacionados a la simbiosis muestra que las PvMDH presentaron valores similares, independientemente del tratamiento, en donde PvMDH1 y PvMDH7 mostraron un valor bajo de lecturas, en contraste PvMDH6 y PvMDH8 mostraron siempre un valor alto, lo cual puede estar relacionado con su función, tipo de gen o localización subcelular, esto brinda una oportunidad para futuras investigaciones"